El Instituto Electoral del Estado (IEE) confirmó el robo de más de 2 mil boletas destinadas al Distrito Local 11 en la elección para gobernador, alcalde de la capital y congreso local, sucedido la noche del lunes 27 de mayo. El incidente tuvo lugar en la colonia Del Valle, al oriente de Puebla, donde se sustrajo papelería electoral de un vehículo utilizado por personal del instituto. Contrario a rumores iniciales, el material no fue arrebatado al capacitador que lo transportaba hacia una casilla. El automóvil fue robado con documentación y boletas electorales en su interior, incluyendo 695 boletas para la elección de gobernador, 695 para diputaciones locales y 695 para el ayuntamiento. El IEE ha presentado una denuncia ante la Fiscalía General del Estado de Puebla en relación con este incidente.
Representantes de partidos políticos respaldaron la versión del IEE, destacando que el objetivo del robo parecía ser el vehículo en sí, y no el material electoral que transportaba. Tanto Olga Lucía Romero, dirigente de Morena en el estado, como Augusta Díaz de Rivera, presidenta del PAN, coincidieron en esta apreciación. Según testimonios, un grupo de hombres siguió al capacitador, lo interceptó y le sustrajo los paquetes electorales. Mario Riestra, candidato a la alcaldía de Puebla por la coalición «Mejor Rumbo por Puebla», conformada por PRI-PAN-PRD-PSI, también denunció el robo de las boletas a través de sus redes sociales.