Ubicado sobre la calle Guerrero, en el Centro Histórico de Querétaro, el Museo de la Ciudad fue fundado el 14 de febrero de 1997, y desde entonces ha fungido como referente del arte para dar difusión y exposición a los jóvenes que desarrollan obras de arte.
Anteriormente, el inmueble pertenecía al ex convento de San José de Gracia de las Religiosas Capuchinas. La construcción del edificio comenzó en 1718 de la mano de don Juan Caballero y Osio y hasta 1859 se convirtió en convento para enclaustrar a las monjas, y en cuartel donde Maximiliano de Habsburgo estuvo como prisionero días antes de su fusilamiento.
Las salas de exhibición que se ubican en las dos plantas de la edificación; salas de talleres educativos, espacios escénicos, entre ellos un foro con capacidad de 400 personas, un auditorio y un teatrino; bodegas para el resguardo de obras de arte; y los patios centrales.
